Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trav12-2A0N8N6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trav12-2A0N8N6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trav12-2A0N8N6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trav12-2A0N8N6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trav12-2A0N8N6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trav12-2A0N8N6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trav12-2A0N8N6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trav12-2A0N8N6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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