Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc173A0JLY1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc173A0JLY1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms