Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms