Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms