Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms