Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Trbv2A0A0B4J1G8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Trbv2A0A0B4J1G8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Trbv2A0A0B4J1G8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trbv2A0A0B4J1G8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trbv2A0A0B4J1G8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trbv2A0A0B4J1G8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trbv2A0A0B4J1G8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Trbv2A0A0B4J1G8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Trbv2A0A0B4J1G8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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