Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G7

Trbv1, T cell receptor beta, variable 1 (Fragment), mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv1A0A0B4J1G7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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