Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Irx4Q9QY61 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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