Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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Chmp3Q9CQ10 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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Chmp3Q9CQ10 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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Chmp3Q9CQ10 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Chmp3Q9CQ10 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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Chmp3Q9CQ10 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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Chmp3Q9CQ10 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
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Chmp3Q9CQ10 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Chmp3Q9CQ10 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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Chmp3Q9CQ10 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Chmp3Q9CQ10 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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Chmp3Q9CQ10 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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Chmp3Q9CQ10 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
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Chmp3Q9CQ10 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Chmp3Q9CQ10 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Chmp3Q9CQ10 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Chmp3Q9CQ10 Olfr105-ps-202ENSMUST00000215518 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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Chmp3Q9CQ10 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Chmp3Q9CQ10 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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