Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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