Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Vipas39Q8BGQ1 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms