Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU3

Mvb12a, Multivesicular body subunit 12A, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12aQ78HU3 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Mvb12aQ78HU3 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Mvb12aQ78HU3 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Mvb12aQ78HU3 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Mvb12aQ78HU3 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Mvb12aQ78HU3 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Mvb12aQ78HU3 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Mvb12aQ78HU3 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Mvb12aQ78HU3 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Mvb12aQ78HU3 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Mvb12aQ78HU3 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Mvb12aQ78HU3 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms