Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Cpne9Q1RLL3 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Cpne9Q1RLL3 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cpne9Q1RLL3 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cpne9Q1RLL3 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cpne9Q1RLL3 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cpne9Q1RLL3 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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