Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Hif3aQ0VBL6 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Hif3aQ0VBL6 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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