Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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Hoxd10P28359 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd10P28359 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
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