Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Gm20828J3KMI7 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Gm20828J3KMI7 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.4 ms