Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Snora16a-201ENSMUST00000083163 136 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Mir6961-201ENSMUST00000183874 67 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC-0.6□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.6□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Mir717-201ENSMUST00000102259 109 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm23483-201ENSMUST00000104179 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm22938-201ENSMUST00000103956 120 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm44311-201ENSMUST00000196448 69 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm22813-202ENSMUST00000200346 124 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm25472-201ENSMUST00000175454 78 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Mir7055-201ENSMUST00000197423 59 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm24554-201ENSMUST00000158654 73 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
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