Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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Ccdc171E9Q1U1 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Ccdc171E9Q1U1 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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