Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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Rtf1A2AQ19 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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Rtf1A2AQ19 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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Rtf1A2AQ19 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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Rtf1A2AQ19 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rtf1A2AQ19 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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Rtf1A2AQ19 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Rtf1A2AQ19 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rtf1A2AQ19 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Rtf1A2AQ19 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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