Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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Irx4Q9QY61 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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Irx4Q9QY61 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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Irx4Q9QY61 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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Irx4Q9QY61 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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Irx4Q9QY61 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Irx4Q9QY61 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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