Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
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Pggt1bQ8BUY9 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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Pggt1bQ8BUY9 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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Pggt1bQ8BUY9 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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Pggt1bQ8BUY9 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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