Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LnpkQ7TQ95 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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