Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
Cln5Q3UMW8 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln5Q3UMW8 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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