Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp39Q3TIX9 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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