Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 347.6 ms