Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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Hoxd10P28359 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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Hoxd10P28359 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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Hoxd10P28359 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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Hoxd10P28359 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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Hoxd10P28359 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
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Hoxd10P28359 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd10P28359 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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