Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Olfr1009-203ENSMUST00000216443 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm43883-201ENSMUST00000204002 3750 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 AC113291.1-201ENSMUST00000217557 403 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Tbx22-201ENSMUST00000068451 2947 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd9P28357 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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