Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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