Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Cldn4O35054 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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