Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm24593-201ENSMUST00000122507 106 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.54□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC-0.55□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm24614-201ENSMUST00000083269 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC-0.56□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Mir7038-201ENSMUST00000184833 71 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.56□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Mir7229-201ENSMUST00000197062 53 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm25249-201ENSMUST00000175471 78 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm23904-201ENSMUST00000157567 124 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Mir5124b-201ENSMUST00000184251 85 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ApobE9Q414 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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