Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC0.44□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC0.43□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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