Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Bco1Q9JJS6 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133 ms