Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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Ccdc39Q9D5Y1 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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