Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Olfr577-203ENSMUST00000215237 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Cfh-206ENSMUST00000192880 3746 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm44343-201ENSMUST00000196702 90 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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Chmp3Q9CQ10 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Chmp3Q9CQ10 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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Chmp3Q9CQ10 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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Chmp3Q9CQ10 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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Chmp3Q9CQ10 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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Chmp3Q9CQ10 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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Chmp3Q9CQ10 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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Chmp3Q9CQ10 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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Chmp3Q9CQ10 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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Chmp3Q9CQ10 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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Chmp3Q9CQ10 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Chmp3Q9CQ10 Gm7470-201ENSMUST00000194219 2095 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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