Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.17
Usp27Q8CEG8 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Usp27Q8CEG8 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.1 ms