Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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Pggt1bQ8BUY9 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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Pggt1bQ8BUY9 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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Pggt1bQ8BUY9 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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Pggt1bQ8BUY9 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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Pggt1bQ8BUY9 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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Pggt1bQ8BUY9 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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