Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cpne9Q1RLL3 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cpne9Q1RLL3 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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