Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms