Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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Sh3bp1P55194 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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Sh3bp1P55194 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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Sh3bp1P55194 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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Sh3bp1P55194 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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Sh3bp1P55194 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Sh3bp1P55194 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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