Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccl20O89093 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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