Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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