Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 n-R5s153-201ENSMUST00000083451 116 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm11116-201ENSMUST00000113257 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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