Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
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Ccdc171E9Q1U1 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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Ccdc171E9Q1U1 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
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Ccdc171E9Q1U1 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
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Ccdc171E9Q1U1 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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Ccdc171E9Q1U1 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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Ccdc171E9Q1U1 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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Ccdc171E9Q1U1 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Mir3109-201ENSMUST00000175301 88 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.7 ms