Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ddx60E9PZQ1 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ddx60E9PZQ1 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ddx60E9PZQ1 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ddx60E9PZQ1 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
Ddx60E9PZQ1 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
Ddx60E9PZQ1 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
Ddx60E9PZQ1 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
Ddx60E9PZQ1 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
Ddx60E9PZQ1 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.66□□□□□ -2.51
Ddx60E9PZQ1 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm44457-201ENSMUST00000198109 76 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
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Ddx60E9PZQ1 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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Ddx60E9PZQ1 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm24091-201ENSMUST00000082550 83 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Mir103-1-201ENSMUST00000083619 86 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm23711-201ENSMUST00000083856 83 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
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Ddx60E9PZQ1 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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Ddx60E9PZQ1 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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Ddx60E9PZQ1 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.7□□□□□ -2.52
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Ddx60E9PZQ1 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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Ddx60E9PZQ1 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC-0.71□□□□□ -2.52
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Ddx60E9PZQ1 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
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Ddx60E9PZQ1 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
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Ddx60E9PZQ1 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ddx60E9PZQ1 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
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Ddx60E9PZQ1 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
Ddx60E9PZQ1 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
Ddx60E9PZQ1 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
Ddx60E9PZQ1 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
Ddx60E9PZQ1 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
Ddx60E9PZQ1 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
Ddx60E9PZQ1 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
Ddx60E9PZQ1 Gm24047-201ENSMUST00000102405 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ddx60E9PZQ1 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ddx60E9PZQ1 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms