Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PtpruB1AUH1 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PtpruB1AUH1 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PtpruB1AUH1 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PtpruB1AUH1 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PtpruB1AUH1 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PtpruB1AUH1 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PtpruB1AUH1 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PtpruB1AUH1 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PtpruB1AUH1 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
PtpruB1AUH1 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PtpruB1AUH1 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
PtpruB1AUH1 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PtpruB1AUH1 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PtpruB1AUH1 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PtpruB1AUH1 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
PtpruB1AUH1 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
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