Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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Clstn3Q99JH7 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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Clstn3Q99JH7 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Clstn3Q99JH7 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Clstn3Q99JH7 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Clstn3Q99JH7 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Clstn3Q99JH7 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Clstn3Q99JH7 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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