Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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Pggt1bQ8BUY9 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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Pggt1bQ8BUY9 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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Pggt1bQ8BUY9 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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Pggt1bQ8BUY9 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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Pggt1bQ8BUY9 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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Pggt1bQ8BUY9 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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Pggt1bQ8BUY9 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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Pggt1bQ8BUY9 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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