Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm23314-201ENSMUST00000157218 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Gm23821-201ENSMUST00000158738 106 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Gm44803-201ENSMUST00000204384 156 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ccdc18Q640L5 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm27610-201ENSMUST00000184026 74 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ccdc18Q640L5 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms