Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln5Q3UMW8 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln5Q3UMW8 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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