Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Sh3bp1P55194 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms